本系(所)成立於民國84年，為因應國家發展重點科技政策及落實基礎科學教育之需求，擬定建構本系為「以化學技術(包含)為基礎，以生化科技、材料化學為應用」之教學研究單位。本系之既有特色為結合化學、化工、生物等基礎學科，開發化學工業、農業生產、醫藥製造等之關鍵技術，且著重於有機合成、有機分析、微量分析和生物技術領域，讓學生依其專長與興趣，得到良好的訓練。